一个简单的qPCR小工具

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一个简单的qPCR小工具

一个简单的qPCR小工具

最近开学了忙起来了,更新频率变慢了大家见谅🙇

今天简单跟大家分享一个自己搭的qPCR小工具,可以上传一个csv或excel文件(excel文件第一行得是header不然会报错),自动计算ddCt fold change,并且画一个带统计的柱状图。支持表格导出结果、图表导出(png/pdf),自定义管家基因、样本排序等等。

抢先体验版: https://apps.bioinfospace.com/qpcr-analysis/

输入需要有以下几列:Target(基因)Sample(样本)Cq(Cq/Ct值),顺序没关系,其他列会忽略。

因为是部署在海外,国内的小朋友可能会访问慢/无法访问,不要气馁!!这就把源码也给你分享出来(转载/修改请注明来源~):

https://github.com/mianaz/qpcr_tool

想要自己本地跑/部署非常简单,把repo克隆一下然后在rstudio里运行就好啦~也可以整个文件夹打包上传到云端,比如shinyapps.io

GitHub上的readme和工具里的Help都有更加详细的使用方法。

欢迎试用欢迎反馈~

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